W okolicach cytadeli - Il Castello - wszystkie ludy, zamieszkujące Lipari od 5 tys. lat zostawiły swoje ślady. Znajdują się tu wykopaliska archeologiczne z pozostałościami domostw, budowli i ulic z różnych epok - od okresu brązu (kultura Capo Graziano) do okresu greckiego i rzymskiego.
Museo Archeologico Eoliano prezentuje historę wysp od prehistorii aż do epoki lasycznej, archeologię morską i wulkanologię.